Аннотация. В рамках научно-экономического проекта планируется разработка методологии создания и компьютерное моделирование реагентов для тест-систем, способных в короткое время дать положительную или отрицательную пробу на наличие искомого инфекционного возбудителя КРС.

Новизна. В настоящие дни в практике лабораторной диагностики точная индикация и идентификация инфекционных возбудителей КРС осуществляется в лабораторных помещениях с использованием дорогостоящего оборудования высококомпетентными специалистами в течение длительного времени (~12 часов от момента пробоподготовки до получения результатов диагностики). В случае, когда лабораторное помещение значительно удалено от места расположения стойла, подобный анализ может растянуться вплоть до нескольких недель, что в свою очередь, может нести непоправимый экономический ущерб предприятию. Данный проект призван разработать методологические основы для создания и разработки такой тест-системы, которая не потребовала бы наличия отдельно лабораторного помещения, специальных компетенций и дорогостоящего оборудования, а позволила бы провести диагностику «на местах». Это достижимо с использованием различных вариаций изотермической амплификации, способных дать специфическую реакцию на конкретный возбудитель в течении 30-60 минут при наличии только термостата и необходимой реагентики для выделения биоматериала и постановки эксперимента. В рамках данного проекта будут созданы высокоспецифичные олигонуклеотидные последовательности (комплементарные ДНК или РНК возбудителя), способные в условиях постоянной температуры дать необходимую концентрацию продуктов амплификации для специфической детекции инфекционного агента.

Цель: создание высокоспецифичных олигонуклеотидных последовательностей для видоспецифической детекции инфекционных патогенов методами изотермической амплификации.

Задачи:

• Поиск специфичных локусов в геномах инфекционных возбудителей
• Подбор олигонуклеотидных последовательностей
• Компьютерная оптимизация олигонуклеотидных последовательностей в условиях изотермической амплификации

На страницу проекта