Бактерии и вирусы эволюционируют рядом с друг другом миллиарды лет. Вирусы разрабатывают стратегии по заражению бактерии, бактерии механизмы защиты от вирусов - бактериальные иммунные системы. Компонентами многих бактериальных иммунных систем являются метилтрансферазы. Показано, что вирусы копируют бактериальные метилтрансферазы, чтобы повышать эффективность заражения бактериальных клеток (Murphy et al. 2013). Плазмиды, участвующие в развитии и распространении множественной лекарственной устойчивости бактерий, также кодируют метилтрансферазы, благодаря которым повышается их передача другим бактериям (Wang et al. 2019). Использование метилтрансфераз в генной инженерии повышает эффективность трансфекции генетических вектор в не модельные организмы, значимые для биотехнологической индустрии (Ren et al. 2020), т.к. метилированные векторы не распознаются бактериальными иммунными системами (системами рестрикции и модификации). Несмотря на большую значимость метилтрансфераз для разработки новых способов генной инженерии не модельных организмов, на текущий момент про разнообразие метилтрансфераз известно из работ более, чем 20-летней давности (Bujnicki 2002). Обнаружение генов метилтрансфераз в бактериальных геномах является трудоемкой биоинформатической задачей, создание векторов, устойчивых к бактериальным иммунным системам,- сложной задачей генной инженерии.

Целью данного проекта является платформы для проектирования векторов, устойчивых к бактериальным иммунным системам. Разработанная платформа позволит создавать векторы для генной инженерии бактерий, значимых для биотехнологического производства. Это платформа будет полезна всем, кто занимается генной инженерией не модельных, промышленных микроорганизмов: от научных лабораторий до крупных биотехнологических компаний.