ПЦР тест-система для прогностической оценки течения травмы спинного мозга
Травматическое повреждение спинного мозга (SCI) является серьезным заболеванием, которое оказывает глубокое влияние на физическое и психосоциальное благополучие пациента. На сегодняшний день требуются разработка и внедрения не только новых терапевтических протоколов, но и объективных методов экспресс диагностики. Точная оценка уровня и тяжести tSCI является ключом к прогнозированию функциональных исходов. Учитывая ограниченную доступность чувствительных прогностических методов для диагностики и оценки тяжести травмы спинного мозга, можно сделать вывод, что необходим поиск потенциальных биомаркеров в качестве диагностического и прогностического инструмента у пациентов с данным заболеванием.
На сегодняшний день к принятым диагностическим методам относят магнитно-резонансную томографию и неврологическую оценку по шкале ASIA. Результаты проведения МРТ позвоночника в условиях травмы являются неоднозначными; и при отсутствии неврологического нарушения, рутинное использование МРТ может быть неоправданным. Также МРТ не дает дополнительной прогностической информации о неврологических исходах у пациентов со стабильным неврологическим состоянием и неосложнЕнным повреждением позвоночника.
Что касается шкалы АСИА – ее надежность проверена временем, но тем не менее вариабельность спонтанного восстановления в пределах каждой степени высока.
В этой связи мы проводим оценку транскриптомного профиля ликвора пациентов с травмой спинного мозга с целью поиска потенциальных биомаркеров.
ТСМ обычно приводит к нарушению ГЭБ, что приводит к утечке компонентов нервной ткани в спинномозговую жидкость (ликвор) и кровь. Считается, что изменения экспрессии генов, связанные с процессами, запускаемыми нейротравмой сопровождаются посттранскрипционной регуляцией генов. Среди известных посттранскрипционных регуляторов наибольшее значение имеют микроРНК.
микроРНК, класс коротких некодирующих РНК, в последние годы вызывают особый интерес, поскольку они участвуют в нескольких регуляторных процессах, включая процессы после ТСМ, такие как регуляция посттравматического воспаления, нейропластичности и регенерации аксонов и нейронов. После SCI некоторые из этих микроРНК подвергаются усиленной регуляции, что приводит к снижению экспрессии их генов-мишеней, в то время как другие подвергаются пониженной регуляции.
Это, в свою очередь, приводит к изменению профиля экспрессии микроРНК и, следовательно, к различному измеряемому спектру микроРНК в крови и ЛИКВОРЕ.
В связи с вышесказанным конечный продукт, который мы планируем получить в ходе реализации данного проекта – экспериментальная высокоспецифичная амплификационная тест-система для диагностики и оценки прогностического течения травмы спинного мозга
Главным преимуществом разрабатываемой тест-системы является то, что она будет обладать комплексной оценкой, позволяющей анализировать различные звенья и периоды патогенетического течения нейротравм. Технические параметры разрабатываемой тест-системы предполагают создание панели, состоящей из нескольких (5) биомаркеров, соответствующие молекулы которых в наибольшей степени коррелируют со степенью тяжести нейротравмы и ее прогностическим течением.
Уже был проанализирован транскриптомноый профиль в ликворе пациентов с травмой спинного мозга и проведен биоинформатический анализ полученных данных.
В рамках реализации проекта планируется:
- Провести валидацию данных секвенирования с помощью количественной полимеразной цепной реакции в реальном времени.
- После чего планируется Отобрать конкретные микроРНК для создания диагностической панели для применения в клинической практике.
- И начать этап регистрации разрабатываемой тест-системы.
