В медицине и экспериментальной биологии типична ситуация, когда определенное экспериментальное воздействие доступно для исследования только на опытном (модельном) организме с целью перенести для интерпретации полученный результат на целевой организм, опыт на котором невозможен, сложен, длителен или дорог (по крайней мере, на первой стадии испытаний). Среди опытных воздействий: эффект препарата (лекарства), питания, внутреннее вмешательство (хирургическое, абляция или модификация органа/ткани и др.), внешнее воздействие (дозы облучения, другие экспозиции) и т.д. Экстраполяция (предсказание) результата особенно актуальна для поиска потенциальных белковых или генных мишеней новых лекарственных средств (drug targets) при невыполнимости (или сложности) эксперимента на целевом организме. Целевым является, как правило, человек или экономически важные объекты (сельского хозяйства, аквакультуры и др.). Модельным организмом может быть млекопитающее (например, мышь – широкий спектр экспериментов), амфибия (например, лягушка – главным образом, регенеративная медицина) или другой животный объект, вплоть до популярных и детально документированных беспозвоночных моделей (плодовая муха и др. – генетика и эпигенетика, биология развития, геронтология и др.). Экстраполяция отклика – многосторонняя задача, в настоящее время решаемая путем анализа массивов эмпирически накопленных данных на базе структурного сходства родственных белков, их функциональных классов и кодирующих генов. Продуктом стартапа является коммерческий сервис на основе создаваемого прототипа программного комплекса для предсказания экспрессии генов с использованием принципиально иного подхода: виртуального эксперимента по эволюционной реконструкции в целевом организме совокупности тех хромосомных структур и их регуляций, которые вовлечены в экспрессионный ответ в модельной системе. Этапы работы реализуются биологически обоснованными точными алгоритмами с доказанной низкой вычислительной сложностью, которые эффективно масштабируемы для анализа больших данных на суперкомпьютерной платформе. Для решения комплексной задачи экстраполяции заказчик предоставляет только данные профилирования экспрессии (RNA- или scRNA-Seq), полученные им в эксперименте для модельного организма. Формат сервиса обеспечивает возможность удаленного размещения и сопровождения заказа. Ключевое конкурентное преимущество виртуального эксперимента по сравнению с лабораторным – скорость и низкая стоимость при обоснованности и достоверности результата. Потенциальные заказчики: фармкомпании и организации различных форм собственности в сфере биотехнологии, фармакологии и трансляционной медицины, получающие преимущества для: формулировки и проведения НИОКР по разработке новых лекарственных и корректирующих препаратов с использованием экспериментальных модельных животных (в т.ч. беспозвоночных); проведения доклинических исследований препаратов на экспериментальных модельных животных с переносом результата на целевой объект (обычно на человека); формулировки и проведения любых поисковых НИОКР, требующих экстраполяции результатов на объект исследования при невозможности опыта на нем по разным причинам (этическим или технологическим). Разрабатываемый программный комплекс и сервис на его основе не имеют аналогов в РФ и за рубежом.

Производитель: ОБЩЕСТВО С ОГРАНИЧЕННОЙ ОТВЕТСТВЕННОСТЬЮ "ЭВОГЕНОМАНАЛИТИКА"

IT